A. 請問作為生物信息學專業的人用,這個本本的配置如何
生物信息的計算量很大,對電腦的要求主要集中在操作系統、CPU和內存
顯卡、光碟機和硬碟不是那麼重要
計算機系統 Microsoft Windows XP Professional (32位/Service Pack 3) 最好64位,運算速度快
CPU (英特爾)Intel(R) Celeron(R) M CPU 440 @ 1.86GHz(1866 MHz) 型號比較低
內存 1GB(南亞 PC2-4200 SO-DIMM 533MHz) 現在2G內存應該是主流,主板支持的話4G也好
價格的好,不會貴多少
B. 為什麼很多科研工作者用unix/linux系統而不是windows做生物信息學
linux速度快啊,很老的機器都可以跑linux,windows就不行
linux自由,可以自己裁剪、編譯內核,可以自己定製、編譯文件系統,可大可小。很多路由器就幾M的存儲空間,可以運行linux,裝個windows試試。
linux有強大的命令行shell。比如要替換所有文件中的某個關鍵詞,一個命令就完成了。
linux開放,本身源代碼公開,linux上跑的絕大多數軟體都是開源的
linux是免費的
C. 生物信息學入門,Linux 系統
http://wenku..com/course/view/4fdf50e2524de518964b7d00 這里有視頻教程 看看吧
D. 我進行生物信息學分析,請問,用什麼好
生物信息學(Bioinformatics)是在生命科學的研究中,以計算機為工具對生物信息進行儲存、檢索和分析的科學。它是當今生命科學和自然科學的重大前沿領域之一,同時也將是21世紀自然科學的核心領域之一。其研究重點主要體現在基因組學(Genomics)和蛋白質組學(Proteomics)兩方面,具體說就是從核酸和蛋白質序列出發,分析序列中表達的結構功能的生物信息。
生物信息學是在大分子方面的概念型的生物學,並且使用了信息學的技術,這包括了從應用數學、計算機科學以及統計學等學科衍生而來各種方法,並以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關的信息。(Luscombe,2001)
具體而言,生物信息學作為一門新的學科領域,它是把基因組DNA序列信息分析作為源頭,在獲得蛋白質編碼區的信息後進行蛋白質空間結構模擬和預測,然後依據特定蛋白質的功能進行必要的葯物設計。基因組信息學,蛋白質空間結構模擬以及葯物設計構成了生物信息學的3個重要組成部分。從生物信息學研究的具體內容上看,生物信息學應包括這3個主要部分:⑴新演算法和統計學方法研究;⑵各類數據的分析和解釋;⑶研製有效利用和管理數據新工具。
生物信息學是一門利用計算機技術研究生物系統之規律的學科。
目前的生物信息學基本上只是分子生物學與信息技術(尤其是網際網路技術)的結合體。生物信息學的研究材料和結果就是各種各樣的生物學數據,其研究工具是計算機,研究方法包括對生物學數據的搜索(收集和篩選)、處理(編輯、整理、管理和顯示)及利用(計算、模擬)。
1990年代以來,伴隨著各種基因組測序計劃的展開和分子結構測定技術的突破和Internet的普及,數以百計的生物學資料庫如雨後春筍般迅速出現和成長。對生物信息學工作者提出了嚴峻的挑戰:數以億計的ACGT序列中包涵著什麼信息?基因組中的這些信息怎樣控制有機體的發育?基因組本身又是怎樣進化的?
生物信息學的另一個挑戰是從蛋白質的氨基酸序列預測蛋白質結構。這個難題已困擾理論生物學家達半個多世紀,如今找到問題答案要求正變得日益迫切。諾貝爾獎獲得者W. Gilbert在1991年曾經指出:「傳統生物學解決問題的方式是實驗的。現在,基於全部基因都將知曉,並以電子可操作的方式駐留在資料庫中,新的生物學研究模式的出發點應是理論的。一個科學家將從理論推測出發,然後再回到實驗中去,追蹤或驗證這些理論假設」。
生物信息學的主要研究方向:基因組學 - 蛋白質組學 - 系統生物學 - 比較基因組學,1989年在美國舉辦生物化學系統論與生物數學的計算機模型國際會議,生物信息學發展到了計算生物學、計算系統生物學的時代。
姑且不去引用生物信息學冗長的定義,以通俗的語言闡述其核心應用即是:隨著包括人類基因組計劃在內的生物基因組測序工程的里程碑式的進展,由此產生的包括生物體生老病死的生物數據以前所未有的速度遞增,目前已達到每14個月翻一番的速度。同時隨著互聯網的普及,數以百計的生物學資料庫如雨後春筍般迅速出現和成長。然而這些僅僅是原始生物信息的獲取,是生物信息學產業發展的初級階段,這一階段的生物信息學企業大都以出售生物資料庫為生。以人類基因組測序而聞名的塞萊拉公司即是這一階段的成功代表。
原始的生物信息資源挖掘出來後,生命科學工作者面臨著嚴峻的挑戰:數以億計的ACGT序列中包涵著什麼信息?基因組中的這些信息怎樣控制有機體的發育?基因組本身又是怎樣進化的?生物信息學產業的高級階段體現於此,人類從此進入了以生物信息學為中心的後基因組時代。結合生物信息學的新葯創新工程即是這一階段的典型應用。
折疊
E. 求高手指教,生物信息序列處理的軟體clustal x有沒有適用於vista系統的
win7系統是可以用的。 還沒有發現專門為vista系統開發的clustalx
F. 生物信息採集系統 是什麼
比如medlab。
就是可以採集心電、腦電、肌肉收縮等等生物信號的系統。
G. 人體協調內部的生物信息主要涉及哪兩大系統
人體協調內部的生物信息主要涉及兩大系統:神經系統-協調內、外;內分泌系統-主要協調外部。
哺乳動物和其他較為低等的動物亦有這兩個系統。
H. 學習生物信息必須學習unix操作系統嗎
你想怎麼指點?基本上,是必須要掌握unix系統的,因為很多軟體的分析都是在linux下運行的
I. 生物信息學中甲基化處理使用軟體的Bismark是用Windows系統安裝使用嗎
最好在linux系統,多個線程跑。在windows下,你自己電腦嗎?如果是的話,內存占的有點大,而且臨時文件近1T
J. 生物信息學一些基本的常用軟體有哪些
最常用的東西:
1,你需要會用 Linux,會使用 bash
2,高於入門級的統計學知識,以及一門統計語言,比如 R
3,至少一門編程語言,一般來講 C++, Perl, Python, Java 這幾種中的一種。
4,對於你工作的領域,需要懂這方面的生物學知識,也需要知道目前人們在這個領域里都用什麼其他軟體。
以上四點我覺得必不可少。其他的知識則取決於你是什麼領域。比如如果你要研發高性能的序列比對軟體,則演算法和並行計算的知識必不可少。——本人自己演算法很渣,所以沒有把算啊列在以上必備的知識里。如果要頻繁存取大量數據,則懂得一種資料庫必不可少,比如MySQL。